新疆与中亚五国应在农业科技领域展开全方位的合作，达到优势互补，实现农业科技共同进步，藉此推动农业经济的合作。
中国新疆与中亚五国在农业科技领域的合作具有很强的互补性。中亚五国都是以农牧业（种植业和畜牧业）为主要农业活动的传统农业国家，具有较高的种植和畜牧技术。如中亚五国在棉花种植技术方面尤其是在棉花品种资源的归类和储存方面有一套较为完备的体系，在棉花生长研究、遗传育种及栽培和灌溉制度等方面有较深的研究。新疆在棉花优质品种的改良升级与培育、优质棉花品种的推广、棉花科学种植技术、棉花病虫害防治、轧花工艺和棉纺技术等方面都有较明显的优势。
在水资源方面，中亚五国中除塔吉克斯坦和吉尔吉斯斯坦的地表水资源较丰富外，整个中亚地区降雨量较少且水资源贫乏，又属内陆干旱区域。中亚五国农业节水灌溉面积都较少，对农业节水灌溉技术具有极强的需求。而新疆在地膜覆盖技术和膜下滴灌技术方面具有较成熟的经验和较高的技术水平，其技术水准已达到世界先进水平。
在农业机械化方面，中亚五国的农业机械化率普遍较低，农业生产力发展较滞后。而中国新疆农业机械化率和农业科技水平相比中亚国家较高。
新疆与中亚五国在农业科技领域已有成功的合作，如新疆天业集团自主研发的节水灌溉产品及技术已经走进中亚的哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦和塔吉克斯坦，且已得到推广并在塔吉克斯坦大面积的农作物种植地上应用，使其农作物单产产量提高2到3倍。新疆与中亚五国应在农业科技领域展开全方位的合作，达到优势互补，实现农业科技共同进步，藉此推动农业经济的合作。
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